Chercheur post-doctoral en Gestion des données multimodales et analyse bio-informatique F/H

Employeur

L’université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de mobilité interne. C’est participer à une aventure académique, scientifique et humaine. C’est s’engager à relever les défis du XXIe siècle.

Vous souhaitez faire avancer la recherche cardiaque ? 

Rejoignez l'Institut des Maladies du Rythme Cardiaque (IHU Liryc )! Le Liryc est un des six premiers instituts hospitalo-universitaires créés en France en 2011. ll est organisé en équipes de recherche clinique qui travaillent en étroite collaboration avec des équipes de sciences fondamentales.

Au sein du pôle Physiopathologie, nous étudions le comportement électrique des cellules cardiaques et du cœur pour comprendre les mécanismes des rythmes cardiaques complexes qui conduisent à des arythmies ventriculaires mortelles et à la mort cardiaque subite.

Dans le cadre du projet de recherche MONDRIAN nous recrutons un Chercheur Post-Doctoral en Gestion des données multimodales et analyse bio-informatique F/H.

Cette équipe a pour but d’investiguer, par le biais d’analyses non-cibles sur d’échantillons humains et animaux, ainsi que par l’agrégation de données de santés publique, les biomarqueurs liées à la physiopathologie de la fibrillation auriculaire.

Votre mission

Votre mission contribuera directement au premier objectif du projet : identifier une signature métabolique de la fibrillation auriculaire, sélectionner un ensemble limité de biomarqueurs métaboliques pertinents, et entrainer un algorithme de machine learning pour obtenir un risque du score de récidive une ablation par cathéter.

# Gestion de l’acquisition (dont mining) et contrôle de qualité pour données multimodales

·       Vous procédez au repérage (query), au stockage et à la gestion de données dérivant d’autre investigateurs et/ou de bases de données publiques ou accessibles

 # Analyse et interprétation de données multimodales, notamment de nature démographique, médicale et biologique

·       Vous utilisez les outils, langages de programmation et logiciels pour l’analyse statistique et bio-informatique des données issus d’analyse de type omique associé à des modèles animaux ou patients

·       Une attention particulière est souhaitée pour les stratégies impliquées dans la sélection de biomarqueurs

# Sélection d’un algorithme de machine learning pour estimer le risque de récidive dans de contexte de la prévention tertiaire.

·       Vous entraînez et sélectionnez des algorithmes pour la déterminer un nouveau risque de score de la récidive de la fibrillation auriculaire à 6 mois et 1 an post-recrutement ou thérapie

Vos atouts / Vos talents

Titulaire d’un diplôme de diplôme PhD en bio-informatique, vous avez au préalable validé une formation d’ingénieur en informatique, mathématiques ou en sciences de la vie.

Vous avez déjà travaillé pour un centre recherche académique ou privé, idéalement dans le domaine de la recherche cardiovasculaire.

Des connaissances spécifiques en biologie moléculaire appliquée à la cardiologie ou dans les concepts de physiologie cardiovasculaire seront un plus. 

Une expérience dans le domaine de la recherche en biologie moléculaire liée au métabolisme est souhaitée également.

Plus d’informations :

En rejoignant le Liryc, vous travaillerez aux côtés d’experts passionnés, dans un environnement multiculturel.

Basé à Pessac - accès tram B (arrêt « France Alouette ») bus, vélo. L’IHU Liryc est implanté au cœur du campus du CHU, au plus proche des équipes cliniques, dans un parc arboré. Il est situé à 8 Km du centre-ville de Bordeaux et 60 Km de la côté Atlantique.

CDD de 24 mois

Salaire mensuel brut : entre 2750 et 3000 €

Avantages liés au poste :

50 jours de congés annuels dès la première année

Télétravail possible selon nécessités et organisation du service

Prise en charge à 75% de l’abonnement aux transports en commun de Gironde

Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois

Restauration subventionnée

Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels 

Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail

Parcours d’accueil et formations

Processus de recrutement : après la période de publication de l’annonce, nous prendrons contact avec les candidats retenus pour un entretien organisé avec le(s) manager(s) et le chargé de recrutement.

Pour être complète, votre candidature doit comporter votre CV, une lettre de motivation (2 pages max), une liste de vos publications et coordonnées de vos précédents superviseurs.

Conseil : votre lettre de motivation est lue et nous apporte des éléments complémentaires à votre CV !