Ingénieur de recherche en Intelligence Artificielle F/H

Employeur

L’université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de mobilité interne. C’est participer à une aventure académique, scientifique et humaine. C’est s’engager à relever les défis du XXIe siècle.

Vous souhaitez mettre votre savoir au service de la recherche scientifique en neurosciences ?

Rejoignez l’Institut des Maladies Neurodégénératives (IMN) ! Les recherches menées à l’IMN portent sur les maladies neurodégénératives ainsi que la physiologie du comportement. Les travaux menés par les chercheurs de l’IMN ouvrent la voie de la médecine innovante, notamment dans le domaine de la maladie de Parkinson, les processus de la mémoire, la maladie d’Alzheimer et l’imagerie fonctionnelle.

Dans le cadre de deux projets financés par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), nous recrutons un Ingénieur de recherche en Intelligence Artificielle et Deep Learning F/H.

Votre mission

Vous prendrez part à 2 projets de recherche centrés sur l’intelligence artificielle appliquée à l’imagerie cérébrale humaine :

# DeepRest - Détection de la somnolence & correction fMRI : développement d’un classifieur automatique de la somnolence à partir de signaux cardio-respiratoires mesurés pendant des examens d’IRM fonctionnelle, à des fins de correction des biais dans les analyses en état de repos (resting-state fMRI)

·       Vous développez des modèles d’IA pour la détection de la somnolence : CNN, LSTM, Transformers, U-Net, autoencodeurs

·       Vous intégrez des signaux physiologiques (PPG, respiration) dans un pipeline de classification de séries temporelles

·       Vous testez des stratégies de data augmentation stochastiques et basées sur la connaissance (via HCTSA)

·       Vous appliquez les classifieurs à des données fMRI longitudinales issues de la cohorte d’imagerie (> 1000 patients)

·       Vous mettez en œuvre des stratégies de correction de la somnolence dans les analyses IRMf, par censure des périodes somnolentes ou régression des profils de vigilance après convolution hémodynamique

# OPLA - Segmentation des défauts de la substance blanche sur IRM : développement d’algorithmes robustes de segmentation automatique de lésions cérébrales d’après des images IRM acquises à 0,55 Tesla, en s’appuyant sur des stratégies avancées de transfer learning

·       Vous adaptez les modèles de segmentation des défauts de la substance blanche (SVD) développés sur des images haute résolution (3 Teslas) à la basse résolution (0,55 Tesla)

·       Vous implémentez des stratégies de transfer learning et d’apprentissage adversaria

·       Vous coordonnez ou participez au traçage manuel de données pour la validation des modèles

·       Vous déployez les outils dans un environnement conteneurisé

Le + de cette offre :

Le poste bénéficie également du soutien de l’Institut Hospitalo-Universitaire VBHI de Bordeaux et de moyens techniques de plateformes d’imagerie labellisées.

Ces projets sont co-encadrés par des spécialistes de l’intelligence artificielle issus de laboratoires locaux (INRIA), nationaux (GREYC Caen) et d’une entreprise partenaire (Fealinx Lyon). Participation à des colloques possible.

Vos atouts / Vos talents

Titulaire d’un diplôme d’ingénieur ou de Doctorat en IA, Data Science, Traitement du Signal ou Neuroimagerie, vous avez idéalement une première expérience (stage) en Deep Learning dans le domaine de la recherche en santé.

·       Vous êtes autonome et très rigoureux dans vos travaux

·       Vous faites preuve de capacité à travailler en transverse avec des chercheurs, ingénieurs, cliniciens

·       Vous maîtrisez Python pour des applications scientifiques ; API Pandas, NumPy, Keras, PyTorch ou TensorFlow. Vous avez déjà pratiqué des modèles convolutifs, réseaux récurrents, transformers, autoencoders, etc, sur des données multidimensionnelles (imagerie 3D anatomique ou fonctionnelle, séries temporelles)

·       Vous avez une bonne connaissance des bibliothèques de visualisation : Matplotlib, Seaborn ainsi qu’en structuration des pipelines IA, MLOps ou dockerisation

·       Vous maîtrisez l’anglais (oral et écrit) niveau C1/B2, dans un contexte de travail multiculturel

Plus d’informations :

En rejoignant cette équipe vous travaillerez dans un des 6 piliers de la recherche en neurosciences du Département Bordeaux Neurocampus. Cet environnement exceptionnel favorise une recherche interdisciplinaire en neurosciences, neuroimagerie, intelligence artificielle, santé cérébrale, neuropharmacologie et cognition. Il accueille une communauté scientifique de plus de 700 personnes, dans un lieu conçu pour l'innovation, la collaboration et la formation de haut niveau, avec un cadre de vie attractif.

Basé à Bordeaux - accès tram A (arrêt « Saint Augustin ») bus, vélo.

CDD de 36 mois

Salaire mensuel brut : 2400 €

Avantages liés au poste :

50 jours de congés annuels dès la première année

Télétravail possible

Prise en charge à 75% de l’abonnement aux transports en commun de Gironde

Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois

Restauration subventionnée

Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels 

Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail

Parcours d’accueil et formations

Processus de recrutement : après la période de publication de l’annonce, nous prendrons contact avec les candidats retenus pour un entretien organisé avec le(s) manager(s) et le chargé de recrutement.

Conseil : votre lettre de motivation est lue et nous apporte des éléments complémentaires à votre CV !