Blocs ABC-Informatique et Statistiques appliquées à la Biologie

Informations

Langue d'enseignement : Français
Crédits ECTS: 6

Programme

- Non défini -

Objectifs et compétences

Objectifs :
Cette UE est destinée à donner aux biologistes une formation initiale à l'informatique en leur permettant de manipuler les notions de base en programmation et de les mettre en œuvre grâce à un langage informatique couramment utilisé pour les applications en biologie. A l'issue de la formation l'étudiant sera capable d'utiliser des librairies spécialisées de traitement et de visualisation des données scientifiques pour les appliquer à l’analyse de données scientifiques. D'autre part, il sera en mesure d'utiliser ses compétences en informatiques pour automatiser des procédures d'analyse statistique et ainsi d'approfondir, d'étendre et d'améliorer son degré d'autonomie sur les compétences précédemment acquises en biostatistiques. Les éléments de statistique avancée qui seront abordés permettront par ailleurs à l'étudiant d'émettre une évaluation critique des méthodes appliquées ainsi que la capacité de défendre et d'argumenter ses choix.

Compétences :
  • Utiliser des logiciels d’acquisition et d’analyse de données propres au domaine
  • Travailler en réseau, utiliser les outils numériques de communication et de travail collaboratif.

  • Proposer un schéma expérimental pour tester une hypothèse
  • Etre en capacité d’apprécier les limites de validité et les conditions d’application d’un modèle

  • Choisir un test statistique en fonction d'une question, d'un contexte et d'un format de données en en interpréter les résultats
  • Comprendre les principes, bénéfices et limites de la modélisation informatique en biologie
  • Connaître les principes de base de l'algorithmique
  • Utiliser des logiciels d’acquisition, de visualisation et d’analyse de données propres au domaine

  • Etre capable d’utiliser des outils mathématiques nécessaires à l'analyse, à la compréhension et à la modélisation de phénomènes biologiques simples. Avoir acquis les bases méthodologiques en probabilités et en statistiques pour leurs applications aux sciences du vivant.
  • Utiliser les outils mathématiques pour la description et la modélisation de phénomènes biologiques simples.

Organisation pédagogique

le mode de fonctionnement de l'UE est présenté au début des enseignements

Contrôle des connaissances

SESSION 1: 1 épreuve de contrôle continu sur mini-projet pour chaque partie (statistique et informatique) sur la dernière séance de TD machine : coef 1

SESSION 2: oral avec préparation d'un mini-sujet et présentation/questions : coef 1

Lectures recommandées

l'ensemble des références bibliographiques est communiqué au début des enseignements

Responsable de l'unité d'enseignement

Andre Garenne

Enseignants

la composition de l'ensemble de l'équipe pédagogique est communiquée au début des enseignements