Nouvelles technologies de séquençage (NGS) : production et traitement bioinformatique des données

De la définition d’un protocole d’expérimentation à l’analyse des données avec Galaxy : Cette formation vous apportera les éléments théoriques et pratiques permettant de comprendre les nouvelles techniques de séquençage pour définir des protocoles expérimentaux et analyser in silico les données résultantes avec Galaxy.

OBJECTIFS

  • Acquérir les notions nécessaires à l'utilisation des nouvelles technologies de séquencage
  • Comprendre et savoir choisir les protocoles expérimentaux adaptés à des questions scientifiques
  • Définir un protocole d’analyse bioinformatique : choisir les bons outils et comprendre les formats de données
  • Traiter les données avec Galaxy (serveur web d’applications NGS) et les interpréter

PROGRAMME

Apports théoriques

JOUR 1 et 2

  • Introduction sur les technologies NGS
  • Applications technologiques et production de données (reséquençage,RNA-SEQ, CHIPSEQ…)
  • Choisir la technologie en fonctiondes besoins
  • Design d’une expérimentation

Applications pratiques

JOURS 1 & 2

  • Analyser les données de NGS avec Galaxy
  • Évaluation et filtrage de la qualité des résultats de séquençage
  • Mapping sur génome de référence
  • Détection de variants génomiques (SNP)
  • Analyses RNA-Seq

Pré-requis : Notions de base en biologie moléculaire

PUBLIC CIBLE : Scientifiques travaillant au sein d’un service de recherche/développement, d’un laboratoire d’analyses

Durée :
2 jours, soit 15 heures de formation

Dates : jeudi 14 et vendredi 15 mai 2020

Satisfaction des stagiaires

  • 100% des inscrits ont trouvé que la formation correspondait à leurs attentes
  • Ils recommandent cette formation à 95%

Lieu : Campus de Talence

Tarif : 1 290 € nets de taxes
(déjeuner offert)

Mise à jour le 03/12/2019

Contact & inscriptions

05 40 00 25 74 ou 64 50
Contacter par courriel

TRAITEMENT BIOINFORMATIQUE DES NOUVELLES TECHNOLOGIES DE SEQUENCAGE (NGS)